Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT35Q92764 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT35Q92764 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms