Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP6NLQ92738 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP6NLQ92738 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6NLQ92738 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms