Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms