Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMPDL3AQ92484 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPDL3AQ92484 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms