Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKIN2Q8WXE0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKIN2Q8WXE0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms