Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR60Q8WVS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR60Q8WVS4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR60Q8WVS4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
WDR60Q8WVS4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.33■■□□□ 1
WDR60Q8WVS4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms