Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCFD1Q8WVM8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCFD1Q8WVM8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCFD1Q8WVM8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms