Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSKUQ8WUA8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSKUQ8WUA8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSKUQ8WUA8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSKUQ8WUA8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSKUQ8WUA8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSKUQ8WUA8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms