Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GIPC3Q8TF64 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GIPC3Q8TF64 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms