Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC43.1■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
RB1CC1Q8TDY2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
RB1CC1Q8TDY2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms