Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6DQ8NFY4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6DQ8NFY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms