Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC148Q8NFR7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms