Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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ZNF548Q8NEK5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF548Q8NEK5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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