Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CARMIL3Q8ND23 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CARMIL3Q8ND23 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms