Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM71DQ8N9W8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM71DQ8N9W8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms