Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC71Q8N4P6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC71Q8N4P6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC71Q8N4P6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC71Q8N4P6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC71Q8N4P6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC71Q8N4P6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC71Q8N4P6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC71Q8N4P6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC71Q8N4P6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC71Q8N4P6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC71Q8N4P6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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