Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHTF2Q8N3S3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHTF2Q8N3S3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms