Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP3Q8IZU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP3Q8IZU3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms