Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMNTD2Q8IXW0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMNTD2Q8IXW0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms