Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC6Q8IVU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HERC6Q8IVU3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERC6Q8IVU3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms