Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREML1Q86YW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TREML1Q86YW5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms