Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GATAD2AQ86YP4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GATAD2AQ86YP4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms