Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAINQ86UA6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms