Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTU1Q7Z7A3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTU1Q7Z7A3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTU1Q7Z7A3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms