Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEGR1Q7Z3B1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEGR1Q7Z3B1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms