Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TCF23Q7RTU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCF23Q7RTU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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