Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC29A4Q7RTT9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms