Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTOP3Q7RTS5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms