Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRADAQ7RTN6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRADAQ7RTN6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms