Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms