Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMUB2Q71RG4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms