Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD1Q719H9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD1Q719H9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD1Q719H9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCTD1Q719H9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCTD1Q719H9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCTD1Q719H9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms