Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP34Q70CQ2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP34Q70CQ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP34Q70CQ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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