Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM43Q6ZSC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBM43Q6ZSC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM43Q6ZSC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms