Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRT6

PRR23B, Proline-rich protein 23B, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23BQ6ZRT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR23BQ6ZRT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR23BQ6ZRT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms