Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC141Q6ZP82 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCDC141Q6ZP82 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC141Q6ZP82 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms