Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CD109Q6YHK3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CD109Q6YHK3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CD109Q6YHK3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms