Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXD4L3Q6VB84 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXD4L3Q6VB84 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXD4L3Q6VB84 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms