Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO4Q6UY18 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINGO4Q6UY18 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms