Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRIG3Q6UXM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIG3Q6UXM1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms