Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SUSD1Q6UWL2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUSD1Q6UWL2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.9 ms