Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A10Q6U841 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms