Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC1Q6TDU7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC1Q6TDU7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC1Q6TDU7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms