Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOA5Q6Q788 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms