Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8BQ6P9F7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms