Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPF40BQ6NWY9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF40BQ6NWY9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms