Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RWDD4Q6NW29 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RWDD4Q6NW29 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms