Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWSAP1Q6NVH7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms