Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPPQ6IPU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPPQ6IPU0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPPQ6IPU0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms