Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPRIN2Q6IMN6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms